В лицее имеется пришкольный интернат с комфортными условиями проживания на 55 мест. Интернат предоставляется для ребят, проживающих за пределами города Томска. Обучающиеся, проживающие в пришкольном интернате получают пятиразовое питание за счет средств областного бюджета. Здание интерната соединятся со зданием лицея теплым переходом.
Плата за проживание в пришкольном интернате с обучающихся не взимается.