Основные образовательные программы на 2019-2020 учебный год представляет собой систему документов, разработанную в соответствии с федеральным компонентом Государственного образовательного стандарта (утвержден приказом Министерства образования РФ от 05.03.2004 №1089), с федеральным государственным образовательным стандартом основного общего образования (утвержден приказом Министерства образованияи науки Российской Федерации от «17» декабря 2010 г. № 1897), со ст. 12 Федерального закона от 29.12.2012 № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации».
Основные образовательные программы основного и среднего уровней образования ОГБОУ «ТФТЛ» являются основными нормативными документами, которые, определяет цели, задачи, планируемые результаты, содержание и организацию образовательного процесса, и реализуются через урочную и внеурочную деятельность с соблюдением требований государственных санитарно-эпидемиологических правил и нормативов.

Основные образовательные программы направленны на развитие технических способностей, знакомство с инженерными профессиями и ориентацией школьников на инженерно-техническое образование.
Учебный план ОГБОУ «Томский физико-технический лицей» содержит дисциплины, обеспечивающие пропедевтику инженерно-технического образования. Профильными в лицее являются три предмета: математика, физика и информатика, углубленное изучение которых предусматривает увеличение часов во всех классах.
Предмет «Технология» представленмодулями:
«Робототехника» (5-6 классы) по 2 часа в неделю;
«Микроэлектроника» (7 класс) по 2 часа в неделю;
«Черчение» (8 класс) по одному часу в неделю.
Образовательная робототехника является частью учебного плана реализуемой модели технологического образования и инструментом, закладывающим прочные основы системного мышления, интеграции информатики, математики, физики, черчения, технологии, естественных наук.

В вариативную часть учебного плана введены предметы, которые обеспечивают формирование основ инженерной графической подготовки и исследовательской деятельности школьников:
- предмет «Информатика» (5,6, классы) по 1 часу в неделю
- предмет «Введение в физику» (5-6 классы) по 1 часу в неделю;
- предмет «Наглядная геометрия» (5 класс) 1 час в неделю;
- курс «Физический эксперимент» (10-11 класс) 1 час в неделю,
- курс «Решение нестандартных задач по математике» (10-11 класс) 1 и2 часа в неделю;
- курс «Черчение (основы автоматизированного проектирования)» (8 класс) 1 час в неделю.
Для формирования основ профессионального английского языка введен курс «Технический английский» в 11 классах - 1 час в неделю.
Учебный план внеурочной деятельности и дополнительного образования предлагает учащимся выбор дополнительных программ, релевантных сквозным цифровым технологиям: «Азбука робототехники», «РобоФутбол», «Танцы андроидных роботов», «Подводная робототехника». , «Микроэлектроника».
В рамках внеурочной деятельности также введены курсы:
- «Решение нестандартных задач по математике» для 9 классов;
- «Программирование на Си» для 8 классов;
- «Моделирование на 3D принтере» для 5-7 классов;
- «Немецкий для начинающих» для 5, 8, 9 классов;
- «Шахматы» для 5 классов;
- «Основы журналистики» для 7-8 классов;
- «Волейбол» для 8-9 классов;
- «Спортивные игры» для 5-7 классов.
Дополнительные курсы формируют основы инженерного творчества, проектного мастерства, нацеленность на результат и умение работать в команде.
Для достижения успешных результатов выстроена система дополнительных курсов по решению нестандартных и олимпиадных задач по математике (5-11 классы) и физике (8-11 классы) через внеурочную деятельность и факультативные курсы.